藥師灌頂真言是藥師佛的根本真言，這個真言出自於《藥師琉璃光本願功德經》。

釋迦牟尼佛告訴文殊師利說「時彼世尊入三摩地，名曰除滅一切眾生苦惱。」
「既入定已，於肉體中出大光明，光中演說大陀羅尼。」就是這個藥師灌頂真言。藥師灌頂真言的功用就是使得一切眾生諸苦皆除。

誠心修持讀頌《藥師灌頂真言》，能連結藥師佛的能量，為自己與他人祈福，特別針對現世的滅除疾病、消災延壽有不可思議的加持。

有些人覺得生病才應修藥師佛，實際上並非如此，眾生的病症，從狹義看是指身體的疾病；而尚未開悟的眾生都有各種煩惱、困擾騷亂身心，特別是貪、瞋、痴等相互混合而產生繁雜的八萬四千種不同煩惱煎迫，使身體、心理受到病苦之亂；更加廣義的層面來看，國家戰爭鬥亂、家庭、婚姻不和睦，就是國家災難受苦、家庭婚姻出現不協調…，諸種關係現象的不和諧，也都需要治療平復。

現代人有疾病在尋醫訪藥、遵循醫囑的同時，若能夠以具信的真誠心，虔敬祈禱 藥師七佛，則對滅除疾病、消災延壽有極大助益。 得到 藥師七佛的加持，不僅對重病的人很有加持，還會帶來事業、修行或者其他事行的成功。

誠心修持讀頌《藥師灌頂真言》，能連結藥師佛的能量，為自己與他人祈福，護持身心安康、消災免難、遠離病痛、得無量福慧、拔除一切業障。


《藥師灌頂真言》
南無薄伽伐帝。鞞殺社。窶嚕薜琉璃。 鉢喇婆。喝囉闍也。
怛他揭多也。阿囉喝帝。三藐三勃陀耶。怛姪他。
唵。鞞殺逝。鞞殺逝。鞞薩社。三沒揭帝。莎訶。

咒語本不翻譯，即四不譯中之秘密不譯。
陀羅尼為總持的意思，即總一切法，持無量義，就是總攝一切善法，其義理是無量無邊，不可說、不可說的。
以下略作解釋，但念誦時，還是要念原文哦。

「南無」即：皈依、皈命。
「薄伽伐帝」即：世尊。
「鞞殺社窶嚕」即：藥師。
「薜琉璃」即：琉璃。
「鉢喇婆」 即：光。
「喝囉闍也」即：王。
「怛陀揭多耶」 即：如來。
「阿囉訶帝」 即：應（供）。
「三藐三勃陀耶」 即：等正覺。
的意義為：皈命世尊藥師琉璃光王如來、應、等正覺。

「怛侄他」 即是即說咒曰。
「唵」 讀作嗡，意義深遠，略說其意如下：
1.皈依義，集中身心，向於三寶；
2.警覺義，提起注意，將精神集中起來於一處。
「鞞殺逝，鞞殺逝，鞞殺社」即：藥！藥！藥！以藥醫治，使其康復。
「三沒揭帝」即：普遍救度一切眾生。
「娑訶」也作「娑婆訶」，即：速得成就。

此咒上半部分是皈依藥師如來，下半部分是以藥治療一切眾生病苦，迅速成就。
整體意義為「皈依世尊藥師琉璃光王如來、應正等覺，即說咒曰：唵，藥之，藥之，藥之而痊癒，普度一切眾生，速得成就！」


【 藥師灌頂真言修持儀軌 】

一、發願文：
稽首三界尊，皈依十方佛，我今發宏願，持此藥師經。
上報四重恩，下濟三途苦，若有見聞者，悉發菩提心，
盡此一報身，同生琉璃國。親覲大慈父，殷勤聞真諦，
學習狮子吼，回返娑婆地，度眾脱苦海，弘法利群迷。

二、藥師灌頂真言（108遍）：
南無薄伽伐帝。鞞殺社。窶嚕薜琉璃。鉢喇婆。喝囉闍也。怛陀揭多耶。阿囉訶帝。三藐三勃陀耶。怛姪他。
唵。鞞殺逝。鞞殺逝。鞞殺社。三沒揭帝。娑訶。

三、迴向
願所有修持功德皆悉迴向盡法界、虛空界一切眾生，依佛菩薩威德力，普願消除一切罪障，福慧具足，常得安樂，無諸病苦。

弘一大師曾言：回向發願，為修持者最切要之事。若不回向，則前所修之功德無所歸趣。
修持必須至心誠懇，不可隨便潦草。印光老法師雲：「有一分恭敬，得一分利益；有十分恭敬，得十分利益。」

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